Diagnosen af skizofreni er ofte ikke let at gøre. Det er ikke muligt at stille diagnosen på et møde. Selv hvis personen har psykotiske symptomer, betyder ikke, at han eller hun har skizofreni. Det kan tage måneder eller endda år for at se, hvis mønsteret af sygdom passer til beskrivelsen af skizofreni.
Ligesom der er mange årsager til feber, der er mange årsager til psykose. Klinikeren foretage evalueringen vil se for nogle af disse andre årsager, for eksempel, en stemning lidelse, et medicinsk problem eller et giftigt stof. Eksperter ved, at hjernens funktion er svækket i skizofreni, men test, der undersøger hjernen direkte kan endnu ikke bruges til at stille en diagnose. En kliniker kan gøre tests såsom computertomografi (CT), magnetisk resonans (MRI) eller elektroencefalogram (EEG). Disse prøver vil hjælpe til at udelukke årsager til symptomerne bortset skizofreni, såsom en tumor eller krampeanfald.